Kereta api Kutojaya Selatan adalah nama kereta api kelas ekonomi yang melayani koridor Kutoarjo – Kiaracondong. Kereta api ini dulunya bernama Kereta api Sawunggalih Selatan. Kereta api Kutojaya Selatan membawa 6 rangkaian kereta ekonomi (K3), 1 Kereta Makan Pembangkit (KMP3) dan 1 aling-aling (B).

Berikut ini adalah jadwal perjalanan kereta api Kutojaya Selatan per 1 Desember 2019 (berdasarkan Gapeka 2019)

KA 331 Kutojaya Selatan (Kutoarjo – Kiaracondong)
StasiunDatangBerangkat
Kutoarjo-09.30
Kutowinangun09.4809.50
Kebumen10.0010.03
Karanganyar10.1610.18
Gombong10.2610.28
Sumpiuh10.4310.45
Kroya10.5711.00
Maos11.1511.18
Gandrungmangun11.5412.02
Sidareja12.1012.12
Langen12.4012.49
Banjar13.0113.25
Tasikmalaya14.1214.20
Cipeundeuy15.0915.19
Kiaracondong17.03-
KA 332 Kutojaya Selatan (Kiaracondong – Kutoarjo)
StasiunDatangBerangkat
Kiaracondong-22.15
Cipeundeuy00.0000.13
Tasikmalaya01.0301.08
Bojong01.3901.48
Banjar02.0502.20
Sidareja02.5402.56
Gandrungmangun03.0403.08
Maos03.4503.49
Kroya04.0304.07
Sumpiuh04.1904.21
Gombong04.3704.39
Karanganyar04.4704.51
Kebumen05.0505.07
Kutoarjo05.33-